تعمل اللجنة الدولية لشؤون المفقودين مع الحكومات ومنظمات المجتمع المدني، والمؤسسات العدلية، والمنظمات الدولية ومع آخرين في جميع أنحاء العالم لمعالجة قضية الأشخاص المفقودين من جراء النزاعات المسلحة، وانتهاكات حقوق الإنسان، والكوارث، والجريمة المنظمة، والهجرة غير الشرعية وأسباب أخرى.
ولكونها المنظمة الدولية الوحيدة المسؤولة حصرًا عن معالجة هذه المشكلة، فإن اللجنة الدولية لشؤون المفقودين تشارك بفاعلية في تطوير المؤسسات وقدرات المجتمع المدني، وفي تعزيز التشريعات، ورعاية الدعوة الاجتماعية والسياسية، وفي توفير الدعم التقني وتطويره لتحديد مواقع وهويات الأشخاص المفقودين.